甲状腺囊肿，尽量避免应用碘剂或减少其用量进行密切观察与随访。对孕妇用碘也应注意，避免新生儿患高碘性甲状腺肿，甚至窒息死亡。对地方性高碘性甲状腺肿应对水源及食物进行过滤吸附，降低碘量。

碘缺乏的散在性甲状腺肿，应以食盐加碘，即食盐中加碘化钠或碘化钾，多采用1∶10000（0.01%）。每天摄碘150～200μg已达预防所需。世界各国所用碘盐含量不一，应视具体需要条件而定，多采用1∶10万～1∶1万（0.001%～0.01%）范围。近年来国内还应用碘油肌注法来预防和治疗，一般成人一次性注射碘油2.5ml（含碘1000mg），可维持疗效5年，甲状腺可明显缩小。儿童需要量比成人要大（按公斤体重计算），1岁左右为125mg含碘量，2～4岁为250mg含碘量，5～9岁为750mg含碘量10岁以上可用成人量达900～1000mg含碘量，因碘油在体内吸收极慢。用后应每年随访，观察疗效。

我国幅员辽阔，地势不一，内陆中有高碘地区如山西省孝义县，可与内陆缺碘并存。沿海高碘区如山东省日照市，可与山区缺碘并存。故多有相互为邻的现象，因而不能统一都用碘剂防治，因为对高碘甲状腺肿患者不利，易导致甲亢的发生，应引起注意。防治甲状腺肿必须各省市进行分别调查，取得基本资料后进行分析，分别对待才能有效防治散发性单纯性甲状腺肿和地方性甲状腺肿。